攻略
攻略に詰まったらご覧ください。
零号 石動邸
東都で起こった子どもの連続怪死事件を追って、日島（ひのしま）県へ来た一（はじめ）。
被害者は皆、口に石を詰め込まれ、右目が抉られていたと言う。
一は遺体発見現場を見て回ろうとするが……。
神石師最初の物語。
【攻略】
近づくと点滅する場所を探してください。チュートリアル回のため、バッドエンドはありません。
壱号 二つのビルの怪異
神木が怒る神社へと向かう、一と綾。その神社は二つのビルの間に鎮座していた。
片方のオフィスビルでは、短期間に連続して人が死んでいる。
一方、反対側に建設されたばかりのミハマコーポレーションは順調に業績を伸ばしていた。
このまま放置すれば死人が増えるかもしれないと綾は言う。
神木がなぜ怒るのか、なぜ片方のビルで死者が出るのか。一は原因の調査に乗り出す。
【攻略】
オフィスビル３階社員の話を聞き、街中の老婆の話を聞く。
神社の鈴を鳴らし異界に切り替え、霊に話しかけ、現世に戻り、霊が探しているアイテムを入手する（スカーフ）。
異界のオフィスビル２階にいる霊の話を聞き、屋上へ向かう。
屋上の鍵を閉め、３階社員からアイテム（天つ金木）を入手し、街中にある異界の本屋で資料を読む。
鈴を鳴らし、現世の街中にいる職人の話を聞きアイテムを入手する（菅細工）。
再度鈴を鳴らし、異界に切り替えてからミハマCo.に向かう。
※ミハマCo.での選択肢によってはバッドエンドになります。
※屋上の鍵を閉めないとバッドエンドになります。
※特に詰みやすい所の選択肢詳細は下記の通りです。
気吹戸主→弥都波能売→最要祓→願い事を書く→細かく割く
弐号 願いが叶う木
神石師の分家筋から木々がざわめいていると情報提供があり、倉木高校へと転校した綾。
学校周辺のどこかに神木があるはずだが、詳細や由来が分からないと言う。
調査を進め、とうとう神木を見つけるが、神木は弱りきっていて今にも朽ち果てそうになっていた。
神石の浄化を阻害する存在、七不思議、そして「がんかさん」のおまじない。
これらの謎を繋げようとした矢先、一人の男子生徒が自死する。
綾は原因究明のため、一に捜査を依頼するが......。
【攻略】
１日目に七不思議を４つ集める。
２日目の昼休みに七不思議を２つ集める。
２日目の夕方に「がんかさん」へ向かい、その後保険医の話を聞く。
※２日目の夕方に「がんかさん」へ向かわず帰宅するとバッドエンドになります。
※３日目の夕方までに７不思議を揃えないとバッドエンドになります。
↓４日目↓
＜夜探索：一（はじめ）＞
旧校舎１階、唱歌室で音楽教師の霊の話を聞き、鍵盤を探す。
鍵盤入手に必要なアイテムを探す。（男女トイレにあるブラシとバケツ、鏡を見つけた幻場にある縄）
１階ー２階の踊り場にいる教師の霊に話しかけ、２階廊下を調べる。
＜夜探索：綾＞
新館２階男子トイレにいる男の子の霊に話しかける。
＜夜探索：一（はじめ）＞
旧校舎１階教室にある「釘抜き」を入手し、図書室近くのトイレにいる女の子の霊に話しかける。
１階ー２階の踊り場にいる教師の霊に再度話しかけ、旧校舎２階廊下の釘を抜き、右隣の教室に入り壁を調べる。
旧校舎１階、唱歌室で鍵盤を入手し、壁を壊すためのアイテム（譜面台）を入手する。
旧校舎２階教室の壁を壊し、男の子の霊を救出する。
＜夜探索：綾＞
新館２階男子トイレ横の教室にいる男の子の霊に話しかける。
図書室書庫にいる女の子の霊に話しかける。
新館と本館をつなぐ廊下にある倉庫に入り、バケツを調べ鍵盤を入手する。
ピアノの椅子を調べ、正しい位置に配置し、現れた音楽教師の霊に話しかける。
本館２階職員室で教師の霊のウワサを入手し、隣の放送室でアイテムを入手する（校歌のテープ）。
校歌を流し、教師の霊と一緒に女の子の霊の所に行く。
＜夜探索：一（はじめ）＞
旧校舎図書室で司書（？）の話を聞き、「がんか」に関する書物を読み、旧校舎理科室の子どもに話しかける。
＜夜探索：綾＞
新館と本館をつなぐ廊下にある倉庫の前を調べる。
＜夜探索：一（はじめ）＞
理科室にある、神木を燃やすアイテムを入手（生灰石、硝子瓶→水）し、神木に向かう。
※裏の七不思議（理科室含む）を解決せず神木を燃やすとノーマルエンドになります。
※保険医フラグを満たすと、エンディングに保険医の物語が加わります。（夜探索時、綾で図書室の本を調べ、本館１階事務室を調べ、保健室の机を調べたのち、保健室の本棚を調べる）
参号 マドイガ
カフェに呼び出された一は、綾から行方不明になった霊能力者の話を聞く。
4人のうち３人は、「マヨイガ」に行ったまま帰って来ず、
帰って来た１人も「マヨイガの庭に大神木が」と呟き病院で死亡したという。
渋る綾を説得し、一は単身三石（みついし）県へと向かった。
そしてたどり着いた先は、噂通り、誰もいない屋敷だった。
【攻略】
蕗のある道を進み、黒い扉から屋敷に向かう。
屋敷に入り、右側の人形の部屋でアイテムを入手する（青い盆）。
台所で湯気の出ている釜を調べ、居間左手のヤカンがある部屋で思念を調べ、左手廊下の姿見を入手する。
姿見を所定の位置に置き、アイテムを入手する（橙の盆）。
大広間の思念を調べ、膳の上に乗っているアイテムを入手（紫の盆）し、食事を正しい位置に置く。
大広間左手床の間に入り、階段近くの部屋でアイテムを入手する（錆びた鍵）。
地下右手の部屋に入り、アイテムを入手する（黄色い盆）。
地下左手の部屋に入り、アイテムを入手する（赤い椀）。
地下奥左手の部屋に入り、アイテムを入手する（神石）。
地下奥大扉手前の部屋に入り、井戸から地上に出て赤い椀を流し、屋敷左手廊下の外にあるアイテムを入手する（桃色の盆）。
地下奥右手（井戸の部屋の隣）に入り、アイテムを入手する（古鏡）。
屋敷正面の庭にある柵の中を調べ、アイテムを入手する（鳥の剣羽）。
地下の大扉を開け、中に入る。
※赤い椀を流さず大扉の中に入るとバッドエンドになります。
肆号 境なる御祖
纉石頭首に願い出て、御祖神社（みおやのかみやしろ）に向かった一（はじめ）。
そこは、多くの神石師が彷徨う、色のない異界だった。
まるで何かを守るように立つ神木、そして遥か昔からそこに佇む大神木。
神石の秘密とは、境の目的とは何なのか。そして、神石師の始祖と呼ばれている御祖石（みおやのいし）の正体は。
神石師最後の物語。
【攻略】
エンドは３種類あります。
※肆号の３つのエンドのうち、＜エンド１＞＜エンド２＞のどちらかをクリアするとスタート画面に「おまけ部屋」が現れますが入れません。＜エンド３＞クリアで入れるようになります。
＜エンド１＞
神木撮影フラグが足りず、かつアイテム（五行の紙）を入手していない。もしくは神木撮影フラグが足りず、かつ選択肢を１つ以上間違える。
＜エンド２＞
神木撮影フラグを満たしているが、アイテム（五行の紙）を入手していない。もしくは神木撮影フラグを満たしているが、選択肢を１つ以上間違える。
＜エンド３＞
すべてのフラグを満たしている。
＜エンド３＞（ベストフラグ）は計１１あります。
家伝の選択肢で正解を選ぶ（２）
五行の図を入手する（１）
神木写真を撮る（４）
※ここまでのフラグ（７つ）を満たすと、鳥居通路に霊が出現します。
霊が指差す場所にある神木写真を撮る（１）
境の目的選択肢で正解を選ぶ（２）
大神木の選択肢で正解を選ぶ（１）